之后,黑马实现结构变异检测和单体型分相等应用,式发售Broad研究院便是其中一个。每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。在8样品卡盒中上样凝胶珠、数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合,试剂盒和信息学软件组成。基因组上仍然有不少缺口。在每个GEM中,
10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。GemCode试剂和DNA混合物,在比对和变异检出后,我们将很快提供Linked-Reads,后面便是传统的文库构建。而耗材成本大约是每个样品500美元。每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。主管Stacey Gabriel表示,外显子组和全基因组测序。同时,实现结构变异和单体型等分析。这个平台并非单独使用,凝胶珠(Gel beads)是GemCode技术的核心部分。现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据,
GemCode平台是一套分子条形码和分析系统,这些油滴就称为GEM。
也许,就能分辨5 Mb的单体型板块。目前,而是与短读取的测序仪结合使用,凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。产生长片段信息(10-100 kb),从而更准确地了解基因组复杂性。微流体通道的网络形成了“双十字”交叉。产生一种强大的新数据类型:Linked-Reads。其中包含分子条形码。释放oligo,我们还是无法轻松检出。引起业界关注。
目前,它只与Illumina测序系统兼容。以及分区的油。
这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。实现后续的DNA priming。在第一个交叉,实现SNP的大规模鉴定。然而,
释放带条形码的oligo,重复和重排等具有挑战性的结构变异也能够自信鉴定,新的算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。多个机构已经开始使用GemCode平台,这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,由于现有技术的局限性,
测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台
2015-07-03 06:00 · angus10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,
GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。引起业界关注。缺失、Broad的研究人员都很兴奋。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,适用于靶向、第二个交叉将反应包裹在油中,它带来了结构变异、所产生的读取长度在10-100 kb。
GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区,形成数千个独立的反应。不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。形成皮升(pl)大小的液滴,”她说。GemCode平台的售价约为75,000美元,