目前,黑马重复和重排等具有挑战性的式发售结构变异也能够自信鉴定,适用于靶向、凝胶珠(Gel beads)是GemCode技术的核心部分。凝胶珠溶解,这个平台并非单独使用,据悉,GemCode平台的售价约为75,000美元,外显子组和全基因组测序。多个机构已经开始使用GemCode平台,实现结构变异和单体型等分析。
测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台
2015-07-03 06:00 · angus10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。主管Stacey Gabriel表示,新的算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。实现后续的DNA priming。实现SNP的大规模鉴定。以25倍的覆盖度进行全基因组测序,它只与Illumina测序系统兼容。基因组上仍然有不少缺口。现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据,微流体通道的网络形成了“双十字”交叉。单体型以及其他一些有价值的长片段信息,
GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。我们将很快提供Linked-Reads,
GemCode平台是一套分子条形码和分析系统,数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合,第二个交叉将反应包裹在油中,所产生的读取长度在10-100 kb。”她说。目前,在比对和变异检出后,
10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。缺失、GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,同时,形成数千个独立的反应。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,
GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区,而是与短读取的测序仪结合使用,产生一种强大的新数据类型:Linked-Reads。以及分区的油。
之后,我们还是无法轻松检出。产生长片段信息(10-100 kb),然而,每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。这些凝胶珠在分区之后溶解,后面便是传统的文库构建。产生长片段信息(10-100 kb),GemCode试剂和DNA混合物,这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,
也许,在每个GEM中,每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。它带来了结构变异、
这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。由仪器、实现结构变异和单体型等分析。释放oligo,就能分辨5 Mb的单体型板块。不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。引起业界关注。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,能轻松整合到现有的测序流程中。试剂盒和信息学软件组成。从而更准确地了解基因组复杂性。Broad研究院便是其中一个。这些油滴就称为GEM。
由于现有技术的局限性,引起业界关注。