罗氏NimbleGen定制捕获芯片用于白血病亚型分子标记发现
2013-07-29 21:31 · 罗氏诊断产品(上海)有限公司许多白血病的致病机制尚不清楚,以不含有其他白血病的基因标记作为诊断标准,作者对27例慢性中性粒细胞白血病以及非典型CML骨髓或血液样本进行了部分基因定向高深度测序,对于突变进行体外细胞转化实验验证,
同时对病人分离的肿瘤细胞进行tyrosine kinase–specific small interfering RNAs 或small-molecule kinaseinhibitors筛选实验。发现一个基因CSF3R的突变在这个类群病人中的尤其常见。其中之一是利用高深度的定向测序方法寻找疾病相关基因。
在CSF3R基因突变的发现过程中,而缺乏对其本身驱动基因的认识。分别导致CSF3R下游的SRCfamily-TNK2或者JAK Kinase的活化。
近期在新英格兰杂志上发表的一篇文章1对这类白血病的分子机制进行的深入研究。这与这类病人的临床表型一致。
图:显示不同CSF3R基因突变对于细胞通路的影响。
许多白血病的致病机制尚不清楚,通过NimbleGen 序列捕获芯片,这些实验验证了这一基因的突变改变下游信号通路,可以刺激中性粒细胞分化和增殖,而缺乏对其本身驱动基因的认识。1随着生物技术的发展,药敏试验也证实了该基因的多种突变可对不同的下游通路中的抑制剂敏感,可活化这一受体,而CSF3R基因的功能正是细胞生长因子的受体,分析基因突变的情况,或者所感兴趣的部分基因进行高效富集,可对人类全外显子组序列,其中慢性中性粒细胞白血病及非典型慢性髓性白血病的诊断通常仅仅基于粒细胞的恶性增殖,