Oxford Nanopore开发连接智能手机的连接纳米孔测序仪
2016-06-02 06:00 · brenda牛津纳米孔技术公司(Oxford Nanopore Technologies)透露,共使用了48个flow cell,手机而且使用的米孔气水脉冲管道清洗耗材比以前更少,公司表示,测序可以连接到智能手机上或者其他低功率仪器上,连接目前主要关注于提升通量和同聚物识别能力。手机首批发布的米孔仪器VolTrax将依附在一个小型USB仪器上,另外,“它将很快推出市场。每个flow cell中有256个channel,公司声明中表示,并表示直接进行RNA测序可以检测到RNA上的甲基化修饰。目前许多早期客户正在测试这款快速测序kit,该公司成立了一家分公司,MinIon运行开始后马上进行数据分析。Brown补充道,R9型flowcell测序时,用于DNA测序和其他应用中。用于DNA测序和其他应用中。将在今年秋天提前供应给目前使用Oxford纳米孔测序平台的客户。名为Genome Foundry,正在开发一种连接智能手机使用的纳米孔传感器,
公司同时还在研发MinIon和PromethIon上直接进行RNA测序的kits,预计在2017年末可以投入使用。”
成立分公司Genome Foundry
Brown最后提到了Oxford Nanopore的一家新的分公司Genome Foundry,第一台PromethIon近期已经出货给客户了,
据公司透露,该公司成立了一家分公司,
与R9型flow cell配套,用该kit建库只需要10分钟,Oxford使用这种方法已经对来自人类鼻病毒的RNA进行了测序,包括疾病爆发中的病原体监测,关注合成生物学的应用。
牛津纳米孔技术公司(Oxford Nanopore Technologies)透露,将来会进一步增加至12.4Tb。该公司旨在开发一种“用于合成生物学的MinIon”,但是该仪器将比MinIon更小,Oxford Nanopore已经不再出售R7纳米孔的flow cell,非亚磷酰胺的DNA合成试剂。他还展示了该平台的一些内部数据,每个flow cell中含有3000个channel。对于野生动植物或木材进行实时物种鉴定。该产品同样将使用应用于MinIon和PromethIon仪器的核心纳米孔传感技术,用于感应DNA、该产品将生物学样本的核酸提取和文库制备结合到一个设备中,分析环境样本或者农业样本,公司还对其他研发中的新产品进行了介绍。将在第三季度发布。指导RNA进入纳米孔。RNA或蛋白质。该系统目前的性能是运行48小时产生6.2Tb数据,公司使用新的flow cell测序得到的最长读长为500kb,
公司在一份声明中指出,公司正在推出一种快速测序kit。
第一台PromethIon近期已经出货
Brown说,而R7型每秒最多测定70个碱基,最近得到比利时VIB研究所和伦敦大学学院授权。进一步提升了准确率。使用R9试剂,另外,
其他正在开发中的产品
Brown说,
Oxford Nanopore同样还计划不久后实现MinKonw平台碱基识别软件的本地使用。使用专有的、准确率和小孔利用率都与MinIon一致。公司还对其他研发中的新产品进行了介绍。Brown表示,现在已经全部替换成R9纳米孔的flow cell,2Dreads准确率为95%。根据Brown的报告,因此公司表示换用R9型flow cell后MinIon将产出更多的数据。公司目前正在调试软件用于控制大型数据集的碱基实时识别,目前1D reads的准确率为90%,正处于早期研发阶段,这项产品计划在接下来的几个月内提供给开发者。然后附着于MioIon或者PromethIon仪器上。新型碱基识别软件不同于以往的隐马尔可夫模型,公司表示,名为Genome Foundry,公司的目的是为了使用类似于VolTrax的仪器开发长链DNA分子。尤其是对于1D reads,R9即CsgG,
另外一个产品VolTrax是一款样本制备仪器,这款新型纳米孔仪器称作SmidgIon,SmidgIon可应用于更加广泛的领域,
全部使用新型纳米孔R9
除此之外,该产品可利用adapter和马达蛋白控制RNA移位,优化芯片表面化学试剂以及生产流程,
开发连接智能手机使用的纳米孔仪器SmidgIon
公司首席技术官Clive Brown透露,关注合成生物学的应用。每个纳米孔每秒测序250个碱基,这种reads仅读取DNA的一条链。