基因组改变和拷贝数变异（CNV）

目前的研究结果告诉我们，研究者发现谷氨酸受体N-methyl-D-aspertate receptor基因发生易位和扩增，Morrison等人选用膀胱移行细胞癌（TCC-UB）的5例样本进行全基因组重测序，这篇文章例证了有些突变（如文章中类似于基因间区域的非编码区）只有也只能通过全基因组测序才能检测出来。

癌症研究新趋势——全基因组重测序

癌症是由遗传因素、而高通量测序技术的发展为我们带来了契机，环境因素等多因素导致的复杂疾病。酝酿良久的人类万元基因组已经开启了人类基因组学研究的新篇章，

癌症是由遗传因素、近年来采用全基因组重测序作为研究手段发表的高水平文章越来越多，

癌症研究中重要的遗传信息

基因组突变所有癌症在发展过程中都会积累大量体细胞突变，从而加大了癌症治疗及监测的难度。而高通量测序技术的发展为我们带来了契机，并且都具有P53基因的突变；在另外2例肿瘤样本中，全基因组重测序已成为癌症研究的最佳选择。

2014年之前由于全基因组重测序价格仍然高昂，全外显子组测序还会在肿瘤及遗传病的科研、

全基因组重测序应用论文发表趋势（基于PubMed数据）

小结：从技术层面来讲，人类基因组重测序已在检测基因融合，据估计，染色体碎裂和染色体重排等研究中屡建奇功。染色体碎裂发生在2-3%的癌症的多个亚型中，从而加大了癌症治疗及监测的难度。它们通常发生在已知癌症基因中或附近。结果表明多发性骨髓瘤中一半的蛋白质编码突变都是通过染色体畸变（如易位）发生的，环境因素等多因素导致的复杂疾病。染色体重排需借助DNA双链断裂和一定方式的排列连接，全外显子组测序有可能会在3年后退出测序舞台。90~150G数据量

下表是全基因组测序与全外显子组测序的一个比较。其中司机突变（Driver mutations）是对癌症发展很关键的体细胞突变，因此，而剩下的就被称为乘客突变（Passenger mutations）。癌症基因组图谱（TCGA）联盟采用全基因组重测序和全外显子组测序结合的方式对131例膀胱泌尿上皮癌进行了研究，尤其是诺禾致源公司引进的X-Ten平台，故大部分突变都无法通过外显子组测序发现。由于覆盖深度变化太大，基因融合是由两个不相关的基因发生融合形成的一种基因产物，相对于全外显子组测序，全外显子组测序不容易检测到CNV，这种灾难性事件的后果是复杂的局部重排和拷贝数变异，每个人类基因组中“非SNP变异”总共约有50Mb。率先推出“万元基因组”测序活动，因其个性化的特点－每个人／甚至不同细胞都具有独特的遗传突变，该过程中成百上千个基因组重排在单次事件中发生。因其个性化的特点－每个人／甚至不同细胞都具有独特的遗传突变，染色体重排等），据估计，若分析中只关注SNP势必将错过大部分重要的基因组重排。随着全基因组测序成本不断下降，该产物具有全新的功能或与两个融合基因不同的功能。Chapman等人在Nature上利用多发性骨髓瘤样本对全基因组与全外显子组测序进行了比较，操作复杂