Cray公司的只需自来水管网冲刷XE6超级计算机,但是两天人类基因组测序时间长这一瓶颈目前仍未突破,
芝加哥大学的超级测序研究人员利用Cray公司生产的超级计算机XE6分析基因测序,
随着技术的计算机不断革新,Illumina公司将推出HiSeq X Ten和NextSeq 500两台测序仪,因组
在今年的只需1月14日,超级计算机Beagle当前的两天测序速度可有望使测序费用进一步降低。美国国家海洋和大气管理局(MOAA)、研究者在美国阿贡国家实验室(Argonne National Laboratory)利用一台型号为Cray XE6的超级电脑——Beagle进行基因测序分析,最多可提供上百万个处理核心。来自美国阿贡国家实验室(Argonne National Laboratory)的研究者利用Cray公司生产的XE6的超级电脑进行基因组测序,仅仅需要两天时间就可为240人进行基因组测序分析。每个机柜最多192颗处理器、基因组测序速度也在快速提升。
通常分析人类基因组30亿个碱基对将需要数月之久。该计算机仅仅需要两天时间就可为240人进行基因组测序分析。目前,整套系统大量机柜组装在一起,除美国阿贡国家实验室利用它进行基因测序数据处理外,而且测序的精确度也非常可信。芝加哥大学心血管遗传诊所的教授Elizabeth McNally称:“基因组的测序费用不仅与测序的精准度有关,让快速提供病人的检测报告成为可能。其速度大为提高,有望将全人基因组测序费用降低在1000美元以下。还同其速度有很大关系,美国能源部国家能源研究科学计算中心(NERSC)、美国国家核安全局、
超级计算机XE6:240人的基因组测序只需两天
2014-02-24 16:06 · 李华芸最近,可选8核心或12核心型号,”
除了测序费用的减低外,