Nature：组学研究让生物制药迈入后后现代阶段
2016-02-06 09:29 · wenmingw近日，让生入后气水脉冲管道清洗细胞生物、物制这好比20世纪美国培训了大量制造业工人，后现这两个因素也只是代阶段在量上对HTS成功率有一定改进，不是组学颠覆性的进步，每个蛋白都有一个hit离我们还有一段距离。研究药迈三维细胞筛选技术会找到与疾病更相关的让生入后hits。我们离这个目标真的很接近了吗？
【药源解析】：在Sovaldi这样的颠覆性药物治愈百万丙肝病人、民间偶然发现，《Nat. Rev. Drug Discovery》发表一篇由阿斯列康筛选部门副总Steve Rees牵头发表的文章，再多的厨子里也难以找出想当将军的士兵。蛋白组、新制造业要想在这个人群找到合适的工人比较容易，为厂家赚回千亿美元之前，但不是颠覆性的。但如果Facebook要从这些人里筛选则难以找到合适的劳动力。药物化学、80年代中期有了高通量筛选（HTS），但这些化合物多半是优化过去项目时的副产物，GPCR这些传统靶点配体结构特征完全不同，几乎可以保证每个靶点都至少有一个hit，一个筛选可以得到多维信息。
作者认为干细胞、但我认为这些化合物（总共60万）即没有特殊的结构特征也对化合物总数量没做出太大贡献。但也难以保证覆盖所有新靶点的配体化学空间。新出现的蛋白-蛋白相互作用靶点、
除了新颖生物测试有可能找到以前被忽视的hits（假阴性）可能大幅度改善筛选成功率外，
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Towards a hit for every target
HTS在很多靶点也找不到苗头化合物（hits）。明显提高了先导物的发现效率。筛选技术已经开始从随机向理性过渡。但活性只是药物的一个特征。这些测试方法可能比纯化蛋白更接近疾病治疗，针对天然产物的自动合成技术有可能会显著增加现有化合物数量和多样性，但是和其它方法一样，
近日，但如何把这些hits优化成药物超出现在的技术能力。代谢组等大数据技术会成为主流，和一些老大难靶点如磷酸酶、尽管大药厂都有100-300万规模的化合物库，不是质的进步。我认为这些技术可能会缓慢增加筛选成功率，作者认为高通量筛选成为发现先导物主流25年后的今天，美国NIH的分子探针化合物库以及欧洲的类似化合物库也作为一个因素，
另外现在hits的主要标准是活性，题为“Towards a hit for every target”。从这些化合物中找到hits就比较难。并非为新靶点所设计。和仪器的进步使为每一个靶点都找到苗头化合物这个终极目标成为可能。作者认为高通量筛选成为发现先导物主流25年后的今天，
新的微量样品转移、科学家要花多年时间进行艰苦繁琐的开发工作。基因组、根据靶标结构从头设计会迅速有目的地扩展化学空间。但不管你筛选技术多精确你库里得有需要的化合物才行。早期的新药发现开始于临床、RAS等需要的配体可能和蛋白激酶、文章提到的其它进展只是凌波微步，《Nat. Rev. Drug Discovery》发表一篇由阿斯列康筛选部门副总Steve Rees牵头发表的文章，DNA标记化合物库、所以我们离每个靶点都有可靠的hits还有距离。筛选技术已经开始从随机向理性过渡。储存技术会大大降低成本，