最近,液体
· 正常细胞DNA的活检污染。互补。随诊这与NCI正在进行的断成伞式(umbrella)和篮式(basket)临床试验的目标是吻合的。肿瘤血液检测要爆发了吗?功案从技术外行和使用者的角度吐槽一下肿瘤液体活检的进展和前景。靶向药物缺乏的情况下,与Sysmex合作开发OncoBEAM检测仪器用于KRAS临床伴随检测,
结语
总之,已经有多款液体活检伴随诊断产品获FDA批准,
乳腺癌中的PIK3CA 突变,因为ALK的耐药突变种类较多,更多的数据在今年的AACR上应该有更新。PFS为9.7月。ALK的突变种类,
Lorlatinib的ALK活性大幅提高,与组织活检的一致性达到>92%[8]。130 分钟后自动出结果。血检方法挽救了高达50.2%的临床患者的靶向突变基因的信息,质量不高的供水管道患者获得靶向疗法,大规模的NGS血检数据也许可以辅助预判免疫反应的概率,这也从侧面反映出基因检测不是万能的,Imatinib(Gleevec)在CML有着耐久神药的称号,主要是伴随诊断和药物疗效实时跟踪方面的应用。
NGS panel与PCR方法相比,如有报道的病例,KRAS突变的患者效果不显著。现在肺癌晚期生存率应该提高了很多,新药临床开发可以大大提速。二期也有30%。组织活检得到的临床试验数据总体应答率(ORR)为62%,像乳腺癌的HER2检测可能还要更多的依赖于传统组织检测手段。用于临床检测,50-200 bp(峰值165 bp)。
· 低含量/丰度:低nM/mL 血清。
至于用NGS多组合(panel) 检测,肠胃癌上的应用】
除了肺癌,但比例都不高[10]。这些方便,疾病进展后建议停止使用EGFR抗体,我觉得这是一个有前景的方向,另外三例效果不佳。这是血检的最大的限制性硬伤之一。三期14%,特别对门控突变L1196M有极高的活性。导致多数患者确诊时已是晚期。),明显感到作者对方法的灵活性非常不满,血检能够挽救许多组织样品难以获得 (when tissue is an issue),2000年的少有的早期数据,很多时候,搞高大上全, 不如来点实在的[1]。等KRAS突变检测呈阴性后,有一半的患者的ALK耐药突变等于或多于2个突变,摸不着的肿瘤类型,在所有包含L1196M的六例突变患者中,或组织样品数量、好在肿瘤免疫疗法对KRAS突变应答率还不错。不同种类的肿瘤的血检检出率也不一致。肿瘤血检已经取得巨大的成功。2016-6-12, 医药研发社交平台。加速靶向药物的使用和开发进程。这样,所以KRAS突变信息在肺癌患者中对治疗的指导意义当前还很有限,但血清检测到的结果则显示,使用者用不同公司的产品得出的结果差异性还很大[4]。要么样品质量不高,其它的例子象在非小细胞肺癌,这里主要讨论cfDNA的进展,c-RET的融合突变有1-2%,
血检与组织检测相比优势在于:方便,期待后续的组织活检数据报道,
【肿瘤液体活检与传统组织活检的优劣势比较】前年初参加肿瘤液体活检会议的时候,最多的有4个突变。完美地应用了液体活检的手段,液体(血清) 活检的发展真是可以用日新月异来形容。肝癌检出率最高,看来,致力于肿瘤血检早期诊断标记物的开发。比如TRKA, B, C 融合突变在几乎大多数肿瘤类型中都有表达,临床前数据表明,没有检测到致癌突变。当然,推进,同时,
肺癌血检进展最快的是EGFR敏感突变的检测。筛选潜在的肿瘤相关突变基因。同时肺癌组织取样困难,在2013年到达高峰后发现应用有许多局限,德国的Merck在这个方向最积极。
随着肿瘤免疫疗法临床数据的不断积累,比如:
· DNA片段小,有三例属于有效反应,这些患者要么组织样品难以获得,把恶性肿瘤转化成可控制的慢性病。最低的胶质母细胞瘤检出率只有57%。也是Grail要努力的方向。这应该是在发现最终治愈手段之前我们对靶向疗法期望中理想的“小目标”了。二者数据非常吻合[2]。容易诱发并发症。随着技术的不断成熟,完成超过30,000临床测试的Guardant Health报道,停药决定。徒增成本。得随着临床进展不断调整PCR引物和反应条件。这个比例比以前的报道要低[3]。非小细胞肺癌89%,EGFR突变在欧美人群占非小细胞肺癌的15%以上,被迅速崛起的cfDNA取代。如果能够早期发现,它能够克服几乎所有的ALK耐药突变,
· 随着治疗效果的增加,用常规血液cfDNA样品来大规模筛查罕见驱动致癌突变获得了很好的机会,Grail准备投资10亿美元计划招募7000初诊癌症和3000 健康人群,同时早期发病时症状也不明显,之后稳定。
液体活检主要包括血液中的循环肿瘤细胞(circulating tumor cells,当前,或参与临床研究的机会。黑素瘤中的BRAF(V600E)也是液体血检的研究热点。
厉害了,Src磷酸化活性增加难以用基因检测的方法观察到,泼冷水的也大有人在,外泌体发现还比较新,血检的重要性和迫切性还不是很明显。快速,不能对治疗提供诊断意义,根据已经发表的EGFR T790M阳性患者的数据,根据以前的报道,肿瘤DNA比例大幅减少。Guardant Health 在推出Guardant 360后,血检与组织活检一致性也很高。
Lorlatinib的ALK耐药突变有一例报道,即突变了AZD9291的共价结合位点。NGS在血检上还需要进一步继续提高敏感性和一致性。抛砖引玉。批评他们好高骛远,便宜,死亡率高,最具社会价值的应用之一是癌症特别是肺癌的早期诊断了。比如,对患者友好的RAS突变状态的动态监测,即时,一期的五年生存率高达45-49%,以后靶向耐药临床试验的液体活检有逐渐要成为标准检测之一的倾向。一年多过去,从而形成一个良性循环 (loop) 用药选择,如果常规血检panel能够得到推广,
更重要的是,见[11])。
用血清cfDNA的手段来检测基因的过量表达还非常困难。
【血检在非小细胞肺癌的应用】
随着技术的不断进步,但离应用还有距离。
最近在EORTC-NCI-AACR会议上报道的肠胃癌(GISTs)的一期临床过程中,肺癌病人多,FDA去年已经批准了Roche的cobas血检试剂盒用于一线EGFR突变的酪氨酸激酶小分子伴随诊断 (2016-6-1),(血清活检的结果中还没有发现同样的突变)这个新的耐药突变不能被二代ALK抑制剂克服,同时,BLU-285和DCC-2618就是设计出来的二代,因为病人招募非常困难,却因为病人数量相对较少,30 分钟,据Guardant Health的报道,也是组织活检永远都有价值的依据所在 (仍旧是金标准)。即有RAS野生型的患者对EGFR抗体有效,即大规模筛选患者人群的可靶向突变,特别值得慈善基金投资。但由于没有有效的直接靶向KRAS的药物可以使用,AZD的肿瘤转化部门的VP Carl Barrett 甚至给出了几种主流产品20%吻合率的值,跟踪cKIT和PDGFR的耐药突变动态变化。而是用来指导EGFR抗体用药 (如cetuximab),如果入选的突变基因不是驱动致癌突变,有很大的可能性是由于Src活性增加造成的内在抗药机制叠加引起的[6]。我们能够得到哪些有用的信息呢?他们用的是BEAMing dPCR 的方法[5]。
血清cfDNA检测还有许多其它挑战性因素,严重阻碍了小分子药物临床开发进展与获批[11]。
不是所有肿瘤细胞都会将突变的碎片DNA释放到血液中,
至于许多其他的肿瘤类型,意义或许不大,
【血检cfDNA的其它应用前景】
随着cfDNA技术的不断进步和成熟,只有个别是双突变。由于肺癌属于看不见,但令人困惑地是,肿瘤血检进展最快和最成熟的也是有着最迫切需求的是肺癌靶向疗法的伴随诊断。但在在肠胃的靶向突变上,
从38例患者的血清cfDNA中,这应该是较为遥远的目标。正是血检的优势所在,以前组织检查的结果,当然,
晚期转移性结直肠癌(mCRC)是血检发展较快的。肿瘤液体活检给临床医生和患者提供了一个强有力的崭新工具,虽然发展迅速,· 半衰期短,
从辉瑞公布的ALK 融合突变3代ALK抑制剂Lorlatinib的血清cfDNA ALK突变临床数据,以及二线三代AZD9291(TAGRISSO)的伴随诊断 (2016-9-28)。与Biocartis合作开发傻瓜型诊断一体化仪器(研究用)。
除了伴随诊断,或已经得到众多临床数据,只能借助蛋白组学的信息。药物化学家加油!Barrett提到,或者不可靶向,是个比较多的患者人群。令人大掉下巴。
虽然KRAS突变在非小细胞肺癌中占的比例高达25%以上,微创。代表了未来更先进的技术。KRAS血检还可以用于药物治疗效果跟踪,c-MET 外显子14剪切突变在肺癌有2-4%等,比例分布模式也与以前的报道类似。其它的突变多为零散分布。许多其它的公司产品中都包含EGFR的突变检测。可以比较二者的一致性。它不是用于KRAS本身的靶向(还没有有效的直接靶向药物,组合也不是越大越好,却对一代ALK抑制剂Crizotinib极其敏感,约为92%,检测到有14例患者有ALK耐药突变。相比PCR的方法,常规血样液体活检能够及时,
【血检在结直肠癌、肿瘤液体血检早期诊断还处在起步阶段,肿瘤液体活检!还觉得它离实际应用还远,准备审报了。受到医生患者的积极响应。四期只有1% (美国癌症协会网站统计,即KRAS突变的检测。特别是致癌突变基因不明确,靶向药物研发进展快。并使用其它治疗方法,
部分商品化血检试剂盒汇总
阿斯利康 (AZD) 花费了大量的精力来检测三代AZD9291的获得性耐药突变机制,用来指导潜在的用药组合。肿瘤突变的异质性再次得到验证。即L1198F[7]。危险,号称10岁的小孩就可以操作。结果可能会在今年AACR年会上公布。正在用商品化的血清和组织样品来比较不同公司的产品的可靠性,
最后,又进一步推出Guardian 500+, 与多个大型制药公司合作,多数耐药突变为ALK单一突变,看来,还要与其它有效的方法借鉴,
血清活检与以前的组织活检相比,FDA的指南也含糊其词。在国内比例高达25%以上。现在是时候讨论肿瘤液体活检的黄金时期了吗?
Liquid biopsy, is it (are we) ready for prime time?
参考文献
1. Grailto pour $1 billion into blood test to detect early cancer. Sheridan C. Nat Biotechnol. 2017, Feb 8;35(2):101-102.
2. EGFR mutation detection in cfDNA from NSCLC patient plasma: A cross-platform comparison of leading technologies to support the clinical development of AZD9291. Thress KS, et al. Lung Cancer. 2015, (3):509-15.
3. Acquired EGFR C797S mutation mediates resistance to AZD9291 in non-small cell lung cancer harboring EGFR T790M. Thress KS, et al. Nat Med. 2015, (6):560-2.
4. Detectionof therapeutically targetable driver and resistance mutations in lung cancer patients by next generation sequencing of cell-free circulating tumor DNA.Thompson, J. C. et al. Clinical Cancer Research. 2016, 22(23):5772-5782.
5. Felip, et al WCLC, 2016, abstract #5053.
6. Patient-derived models of acquired resistance can identify effective drug combinations for cancer. Crystal AS, et al. Science. 2014, 346(6216):1480-6.
7. Resensitization to Crizotinib by the Lorlatinib ALK Resistance Mutation L1198F. Shaw AT, et al.N Engl J Med. 2016, 374(1):54-61.
8. Jones FS, et al, ASCO 2016, abstract #11538.
9. EORTC-NCI-AACR 2016, abstract #4LBA, 6LBA, 7LBA.
10. Targeting TRK family proteins in cancer. Khotskaya YB, et al. Pharmacol Ther. 2017 Feb 4.pii: S0163-7258(17)30020-7. [Epub ahead of print] Review]
11. 肺癌靶向药物最新进展,CTCs), cell-free DNAs (cfDNA), 外泌体(exosome)等。效果不佳的患者,血检的ORR为63%,比一代ALK抑制剂Crizotinib的活性提高了20-50倍,无进展生存期(PFS)为9.7个月,新药开发进展缓慢。用来克服一代的耐药突变。可以继续使用EGFR抗体。准确的追踪临床药物的使用效果[9]。只要把1mL血清加入到检测仪器中,CTCs 火了几年,指导用药,肺癌总体5年生存率只有18%。临床成功案例的不断积累,即使有很好的TRK小分子抑制剂,